Uzumaki
Esse Clã vem do extinto País do Redemoinho, na vila do Vórtice. A mãe de Uzumaki Naruto, Uzumaki Kushina foi trazida para Konoha para ser a segunda jinchuuriki da Kyuubi no Yoko. Kushina foi sucessora de Uzumaki Mito, a primeira jinchuuriki da Kyuubi, que selou a mesma (Kyuubi) dentro de si na luta entre seu marido Senju Hashirama e Uchiha Madara, com isso seu marido derrotou Madara e a partir desse fato Konoha se tornou a dona da Kyuubi (o bijuu mais forte entre os nove). Uzumaki Kushina é mãe de Naruto e também a esposa do Yondaime Hokage considerado pelos moradores de Konoha como o maior de todos os Hokages, pois derrotou a Kyuubi em uma tentativa de Uchiha Madara de se vingar da vila. Ele e Kushina derrotaram e selaram a Kyuubi em seu filho Uzumaki Naruto que se tornou o terceiro Jinchuuriki da Raposa de Nove-Caudas. Uzumaki Naruto é o único remanescente do Clã Uzumaki e descobriu que é filho no Yondaime Hokage na luta contra Pain onde se descontrolou e quase libertou a Kyubbi, mas isso não aconteceu pois seu pai apareceu em sua mente e lhe revelou toda a história. Já sua mãe aparece no mangá 497 na luta entre Naruto e Kyuubi. Naruto estava quase perdendo quando Kushina apareceu em sua mente e lhe ajudou. O Clã Uzumaki e o Clã Senju são parentes distantes. Agora Naruto descobre que vem de uma família de ninjas fortes como seu Pai (Namikaze Minato) e sua mãe, Uzumaki Kushina. Os poucos sobreviventes do clã espalharam-se pelo mundo. Descoberto agora a pouco que havia outro sobrevivente fora Naruto do clã Uzumaki... o nome dele é Uzumaki Nagato. Para se reconhecer aqueles que faziam parte do clã uzumaki era pela cor do cabelo, avermelhado ou simbolo do seu clã(naruto não o cabelo avermelhado pois herdou a fisionomia do pai).
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Uchiha
O clã Uchiha, foi considerado um dos clãs mais poderosos que já existiu, ao lado do Clã Senju era o que fazia frente aos Uchihas. Foi considerado o clã lendário de Konoha, os Uchihas são descendente do filho mais velho do Eremita dos Seis Caminhos, anteriormente à criação de Aldeia da folha. Os membros do clã ao despertar o Sharingan, um olho vermelho com um, dois ou três tomões em volta da pupila, dependendo de seu desenvolvimento, desenvolve a habilidade ver o chacra e de copiar ninjutsus, genjutsus e taijutsus com muita facilidade e armazená-los na mente para usá-los quando bem entender. Os descendentes do clã que despertam o sharingan, o herdam genéticamente, ou seja, somente tendo algum familiar que possua o Sharingan o usuário do clã o herdará. Outra maneira de se obter é fazendo um transplante de olhos (como é o caso do Hatake Kakashi e Danzou) para que outro usuário o tenha, mas com isso, o Sharingan não pode ser desativado, e como o Sharingan usa uma boa quantidade de chakra, normalmente o olho transplantado está coberto, pois os membros do clã que têm a linhagem avançada possuem bastante chakra para poder usá-lo, apesar de que, para os membros do clã, o sharingan quase não consome chakra, fazendo até que alguns membros do clã (como Uchiha Itachi e Tobi) use-o constantemente.
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Hyuuga
Muito respeitados dentro e fora da vila de Konoha, o Clã Hyuuga é um dos clãs mais poderosos no mundo Naruto,depois do Hokage e do Senhor Feudal eles formam a elite da Aldeia da Folha ocupando a posição de familia mais importante do País do Fogo. O clã hyuuga tem como principal característica o Byakugan, uma Kekkei Genkai extremamente poderosa. Os membros mais conhecidos são Hyuuga Neji, Hyuuga Hiashi, Hyuuga Hinata, Hyuuga Hanabi e Hyuuga Hizashi.
O clã é dividido em duas partes: a Família Principal e a Família Secundária. Na família principal, apenas o primeiro filho(a) continua nela. O segundo, o terceiro, e os outros que possam vir, farão parte da família secundária, cujo objetivo é proteger a Família Principal. Para que os membros da Família Secundaria não façam nada de errado, um selo é posto na cabeça deles quando pequenos. Qualquer ação que o membro da principal perceba, com apenas um selo de mão ele pode fazer o membro da Família Secundária tenha uma forte dor de cabeça, causada pela destruição de neurônios, podendo matá-lo. Outro uso do selo é selar todos os conhecimentos do Byakugan quando a pessoa morre, para evitar que o segredo do Byakugan saia do clã. Hyuuga Hiashi e suas filhas Hyuuga Hinata e Hyuuga Hanabi são da Família Principal, enquanto Hyuuga Neji e seu pai Hyuuga Hizashi são da Família Secundária. Hyuuga Hiashi e Hyuuga Hizashi são irmãos gêmeos, mas Hyuuga Hiashi foi para a Família Principal por nascer primeiro. Mesmo assim, o gênio do clã, Hyuuga Neji, o que foi abençoado com a kekkei genkai mais poderosa do clã nasceu na Família Secundária, o que deixa Hyuuga Hiashi numa posição difícil.
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Akimichi
Esse clã de Konoha é composto por membros de corpos obesos. Esse fator é a principal vantagem deles. Com o Baika no Jutsu, eles aumentam o tamanho e peso do corpo, e com isso ganham resistência de ataques e podem executar taijutsus de grande potência, como o Nikudan Sensha.
Dentro do clã existem outros jutsus relacionados ao uso de seus corpos, mas geralmente outros ninjutsus são usados em casos extremos, e com o auxílio das Pílulas Akimichi.
Os membros conhecidos são Akimichi Chouji, Akimichi Torifu e Akimichi Chomaru.
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Inuzuka
É um clã do País do Fogo respeitado, com a peculiaridade de utilizar cachorros como companheiro nas lutas. O ninja recebe seu cão ainda pequeno. Os dois começam a criar uma existência amigável, até ao ponto do ninja entender o que o seu mascote tenta expressar por latidos e gestos. Os dois desenvolvem a confiança entre si.
A luta de um ninja desse clã é sempre fruto de uma aliança entre homem e cão. O cão, quase sempre grande, ataca com força bruta, com a ajuda da força e da estratégia do ninja. Para melhorar sua técnica, o ninja luta como se fosse um animal, aumentando o seu olfato com o acúmulo de chakra na região do nariz, lutando quase sempre de quatro, deixando os seus dentes afiados. Na hora da luta, os dois lutam de forma sincronizada. Para melhorar sua habilidade, é comum o uso de Pílulas do Soldado, que aumenta consideravelmente a força dos dois.
Os cães possuem a capacidade de sentir o "cheiro" da intensidade do chakra, criando assim uma possibilidade para uma retirada.
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Nara
Não é um Clã muito famoso nem grande. Na história de Konoha, é lembrado por deter um conhecimento medicinal excepcional. Tsunade recorreu a tal conhecimento para poder salvar Akimichi Chouji. No entanto, é mais conhecido por suas técnicas eram usadas para segurar um Shinobi (Ninja), enquanto chegava o time de apoio. Por isso, suas técnicas nunca foram próprias para batalha. Quando acontece do Shinobi (Ninja) desse Clã entrar num combate direto, ele sempre apresentava dificuldades. Para evitar problemas, o intelecto do Shinobi (Ninja) é treinado, para facilitar a criação de estratégias.
A manipulação de sombras é limitada, porém útil. O ninja estende a sua sombra para fazer diferentes técnicas. Pode aumentar consideravelmente o alcance se ele usar a sombra de objetos. Ela é facilmente modelável, pode ficar grossa ou fina, porém o alcance dela é sempre o mesmo.
Os membros conhecidos são: Nara Shikaku, Nara Yoshino e Nara Shikamaru.
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Sarutobi
Não é um clã muito conhecido no mundo de Naruto, sua única menção foi ao final do episódio 56 da saga shippuuden (Ver Lista de Episódios), onde Konohamaru menciona que ele, seu tio Sarutobi Asuma, e seu avô Sandaime Hokage fazem parte do Clã Sarutobi.
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Aburame
É um clã muito famoso dentro e fora do País do Fogo, onde residem. São úteis pela sua habilidade de controlar insetos de variados tipos. Apesar de clãs parecidos existirem em outros Países, o Clã Aburame é o maior e o mais famoso. Para ganhar a ajuda dos pequenos seres vivos, são postos no corpo quando ainda é pequeno. Eles se alimentam do chakra do ninja, e em troca são usados na batalha pela manipulação do chakra.
Controlando o seu chakra, o ninja do Clã Aburame pode usar os insetos para um ataque ou defesa, ou ainda para outras finalidades. Os insetos são controlados livremente de várias formas: para picar o inimigo, envenenando (ou paralisando) o oponente; no rastreamento de alguma coisa ou alguém; numa defesa, usando os inúmeros insetos como barreia; e de várias outras maneiras diferentes, como retirar o veneno do corpo.
Os membros conhecidos são Aburame Shino, Aburame Shikuro, Aburame Torune, Aburame Shibi e Aburame Gen.
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Fuuma
O clã Fuuma é um pouco desconhecido (só teve participação no anime), o país de origem do clã é o país do arroz. O país do arroz teve a idéia de aumentar o fornecimento de comida, mas uma guerra iniciou-se. A guerra foi sediada no Reino Kingin, mas nesta guerra muitos shinobis morreram. O clã Fuuma perdeu a guerra junto com o país. As maiorias dos shinobis saíram do país Com o Ninpou: Kazakuno o ninja lança centenas de pequenos insetos que cobrem o local com fios de seda, impedindo qualquer coisa de se movimentar.
Membros conhecidos: Fuuma Sasame, Fuuma Arashi, Fuuma Kagerou, Fuuma Jigumo, Fuuma Hanzaki, Fuuma Kotohime, Fuuma Kamikiri
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Hatake
Um dos clãs pouco conhecidos em Konoha, o Clã Hatake era especialista em utilizar cães e técnicas de rastreamento, como o famoso Clã Inuzuka. Somente dois de seus membros são conhecidos: Hatake Sakumo, o Canino Branco da Folha; e Hatake Kakashi, filho de Hatake Sakumo, chamado de Ninja Copiador.
Diferentemente do Clã Inuzuka, o uso de cães e Nujinko no Jutsu era feito com o auxílio de pergaminhos. Isso é mostrado durante a luta entre Hatake Kakashi e Momochi Zabuza na ponte de Tazuna. Envolto pelo Kirigakure no Jutsu, Hatake Kakashi usa os Ninken (cães ninjas) por meio de invocação com um pergaminho e, aliando ao Doton, ataca com o Hijutsu Ninpou Kuchiyose • Doton: Tsuiga no Jutsu.
Os membros do clã Hatake usam máscaras (talvez pelo simbolismo que a ANBU também possui, com relação a serem perseguidores) desde pequenos, e as invocações e técnicas são ensinadas de pai para filho.
Os membros conhecidos são Hatake Kakashi e Hatake Sakumo.
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Kaguya
O Clã Kaguya era um Clã muito poderoso no país da água, na Vila Oculta da Névoa, por causa de sua Kekkei Genkai. Sempre que começava uma guerra era utilizados, o que fez seus membros ganharem um certo prazer nas guerras, e lutas em geral. Viraram um Clã militar, com interesse apenas na guerra. Se deliciaram com as batalhas da Terceira Guerra Secreta. Quando ela acabou, os membros desse Clã queriam mais, e pensaram em dar um golpe militar em um período de instabilidade da Vila Oculta da Névoa. Juntaram todos os membros do Clã e invadiram, foram massacrados, dizimados. Somente o jovem Kaguya Kimimaro sobreviveu e se aliou a Orochimaru (que tinha o interesse de se apossar de seu corpo quando estivesse pronto).
Sua Kekkei, Genkai, Shikotsumyaku (Passagem dos Ossos do Corpo), permite que o ninja controle livremente os ossos de seu corpo. Ele pode retirar o osso de seu braço e utilizá-lo como arma ou um escudo, ou ainda os dois simultaneamente; atirar pedaços dos ossos para atacar o oponente. Tudo isso somado à rápida recuperação dos ossos faz com que o ninja ataque e se defenda ao mesmo tempo. Normalmente, a limitação desse controle varia de pessoa para pessoa, alguns nascendo com mais controle do que os outros. Mesmo assim, essa Kekkei Genkai traz limitações: pela complexidade do corpo do usuário, raramente um tratamento normal fará resultado. E ainda tem a possibilidade de uma doença rara aparecer nessa pessoa, possivelmente uma espécie de Tuberculose, o que significa a morte dela.
O único membro conhecido é Kaguya Kimimaro.
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Koori
Clã Koori é o suposto clã de quem Haku é membro, assim como sua mãe. Após a guerra civil no País da Água, todos se revoltaram contra os herdeiros de Kekkei Genkai, por considerarem perigosos demais para os habitantes. Foi por essa razão que o Clã Kaguya, também originário da Vila Oculta da Névoa, atacou os habitantes e acabou extinto.
Durante a guerra (que dizem ter sido iniciada pelo Clã Kaguya), Haku, ainda criança, desperta a Kekkei Genkai ao ver sua mãe, também portadora dessa habilidade, ser morta na sua frente pelo seu pai, que passou a temer e odiar sua família. Ao ver isso, Haku acaba matando todos com seu poder.
Alguns membros do Clã Koori possuem o Hyouton no Jutsu, ninjutsu que permite manipular o Hyuuton (gelo) e uma maior facilidade com o Suiton no Jutsu e Fuuton no Jutsu.
Podendo manipular o Suiton (Água) e o Fuuton (Vento), desta maneira, eles podem criar o Hyuuton (Gelo) graças a sua Kekkei Genkai, e usam JutsusEspelhos de Gelo Demoníacos e as Agulhas voadoras Aquáticas. que apenas sua linhagem é capaz, como os Espelhos de Gelo Demoníacos e as Agulhas voadoras Aquáticas.
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Kurama
Clã originário de Konoha. Algumas gerações de membros do Clã Kurama nasceram com o incrível talento para Genjutsu. Seus genjutsus são completamente irresistíveis, tanto que somente uma pessoa de fora pode tirá-la do transe. Além do mais, o Genjutsu é tão poderoso que faz o cérebro crer que o que ocorre com a vítima no Genjutsu é real e se manifesta no corpo dela, permitindo a um membro do clã potencialmente matar seus oponentes com Genjutsu. Contudo, o usuário raramente controla a extenção total das suas habilidades, e com tal seu subconsciente irá geralmente regular esse poder, podendo surgir uma segunda personalidade que controla este poder. Esta personalidade então sobrepõe a original, transformando o indivíduo num monstro que é perigoso a todos que estiverem ao seu redor, como aconteceu com a prodígio do clã, Kurama Yakumo.
Com essa habilidade especial sobre os genjutsus, essas gerações tem o controle sobre todos os genjutsus ativos e passivos, seu controle só não se estende aos genjutsus provenientes de Kekkei Genkai, como o caso do Tsukuyomi do Clã Uchiha, esse controle deve-se ao fato de uma Kekkei Genkai especial do Clã Kurama.
Dentre os Genjutsus mais usados destaca-se o Kokohi no Jutsu, que cria ilusões baseadas em florestas de árvores gigantes. Os membros conhecidos são Kurama Yakumo, Kurama Unkai, Kurama Murakumoto e Kurama Uroko.
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Sarutobi
Não é um clã muito conhecido no mundo de Naruto, sua única menção foi ao final do episódio 56 da saga shippuuden (Ver Lista de Episódios), onde Konohamaru menciona que ele, seu tio Sarutobi Asuma, e seu avô Sandaime Hokage fazem parte do Clã Sarutobi.
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Senju da Floresta
O Clã Senju da Floresta é um Clã muito antigo, na qual seu líder era o Primeiro Hokage, também tinha como membros o Segundo Hokage. Foi revelado recentemente que na verdade Konoha foi criado a partir da junção do Clã Senju e o Clã Uchiha, em que Uchiha Madara era líder. Por problemas políticos Hashirama Senju e Uchiha Madara se enfrentaram no Vale do Fim (vale no qual Uzumaki Naruto e Uchiha Sasuke se enfrentaram), sendo que Hashirama Senju saiu vitorioso, e mais tarde se tornou o Primeiro Hokage de Konoha. Mais tarde o irmão de Shodaime Hokage,Tobirama Senju se torna o Nidaime Hokage.
Os membros conhecidos são: Hashirama Senju (Shodaime Hokage), Nidaime Hokage Tobirama Senju, Tsunade Senju (Godaime Hokage), Nawaki Senju e Touka Senju
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Tsuchigumo
O clã Tsuchigumo foi motivo de grande orgulho. Por possuirem um kinjutsu, eles acreditaram que poderiam mudar o rumo da 3ª guerra ninja. Claro que o kinjutsu os deixou como um alvo constante. Muitas vidas se perderam pois diversos shinobis foram atrás do kinjutsu, e quando a terceira geurra ninja terminou, restaram poucos membros do clã ue estavam aptosa usar o kinjutsu. Em seguida, En-goya e seus ancioes tiveram vários desentendimentos, isso fez com que o clã se dividisse em dois grupos: um na vila Tsuchigumo e outro no monte Katsuragi. Porém En-goya estava muito velho e ninguém quis ficar ao lado dele no monte Katsuragi. O futuro do clã foi contado a Hotaru, pois En-goya acreditava queproteger o nome "Tsuchigumo" seria o mesmo que proteger aqueles que morreram pelo kinjutsu. Atualemnte, ninguém conseguira roubar o kinjutsu, pois seria uma desonra a todo o clã. Também se sabe que o clã já foi muito numeroso, ams suas terras foram tomadas por inimigos. Então, En-goya fez um trato comKonoha para proteger o kinjutsu a qualquer custo.
Os membos conhecidos são Tsuchigumo Hotaru, Tsuchigumo Tonbei, Tsuchigumo En-goya, Tsuchigumo Hato e Tsuchigumo Shiranami.
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Tsurugi
Um Dos Clãs Pouco Conhecidos Sua Primeira aparição é quando um membro chamado Misumi Tsurugi aparece na prova chuunin no time de kabuto outra aparição é mostrada no episodio 213 do mangá um misterioso ninja se revela pertencer ao clã mas é morto logo em seguida por ninjas da aldeia da Chuva.O Clã Tsurugi a maioria de seus ninjas trabalham para Orochimaru. Acredita-se Que Todos Do Clã Possuem O jutsu Nan no Kaizou
Os Membros Conhecidos São Misumi Tsurugi.
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Yotsuki
Esse clã é originário de Rai no Kuni, na Kumogakure no Sato. Somente um integrante seu foi mostrado. Durante a invasão do grupo Taka a essa vila um integrante do Clã foi pego para interrogatório, onde primeiramente Suigetsu o interrogou, sem obter exito, e posteriomente por Uchiha Sasuke que com seu novo Sharingan obtêm exito em retirar a informação desse membro, sendo ela a localização do Jinchuuriki da Hachibi.